Bioinfo Downstream Integration Agent

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上传生物信息分析结果，在一个页面中配置并运行调控子、表达模式与多组学整合流程

这是一款面向生物信息下游分析的交互式网页工具。页面支持拖放或选择 CSV、TSV、XLSX、XLS 文件，并面向 DEG、SCENIC regulon 与 Monocle2 BEAM 结果提供对应分析入口。文件上传后，工具会显示识别状态并根据数据组合开放可用流程。用户可选择 SCENIC 调控子交叉分析、基因表达模式分析或多组学整合；多组学模块可进一步选择 DEG 与 regulon 重叠、DEG 与 BEAM 重叠或三类数据完整整合，并配置 Top N 基因数量以及是否查询文献。

核心亮点

多类结果接入

支持常见表格与三类分析结果

三种分析路径

覆盖调控子、表达模式和多组学

动态数据校验

按上传内容启用流程并提示缺项

整合参数配置

可选整合组合和基因数量

如何使用

准备并上传结果文件
将 DEG、SCENIC regulon 或 Monocle2 BEAM 分析结果整理为 CSV、TSV、XLSX 或 XLS 文件，然后拖入页面中央上传区，或点击上传区从本地选择文件。页面会显示文件路径和识别进度。
选择可用的分析流程
根据上传的数据选择 SCENIC 调控子交叉分析、基因表达模式分析或多组学整合。暂不满足输入条件的流程会保持不可用，帮助确认还需要补充哪类结果文件。
配置整合参数
进入多组学整合后，选择 DEG 与 regulon 重叠、DEG 与 BEAM 重叠或完整整合，按需要设置 Top N 基因数量，并决定是否启用文献查询。
运行并处理输入提示
点击 Run Analysis 启动所选流程。如果当前数据组合不完整，页面会直接提示缺少的输入类型；补充对应文件后再运行，以进入后续分析。